Nature methods:一种提高RNA分子计数准确性的新技术
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作者:李
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发布时间: 415天前
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研究人员设计了一种新的方法来提高测序数据中定量RNA分子的准确性。这项研究的主要重点是解决在测序实验中用于定量RNA分子的唯一分子标识符(UMIs)的PCR扩增错误问题。虽然UMIs在减少PCR偏差方面有效,但与PCR扩增相关的测序错误仍然对准确定量RNA分子构成挑战。该研究提出了一种利用同源三聚体核苷酸块合成UMIs的新方法,该方法有效地纠正了测序错误,并使测序分子的计数更加准确。

图源:Nature methods(2024), DOI: 10.1038/s41592-024-02168-y
UMIs是一种随机的寡核苷酸序列,在测序实验中被广泛用于减轻PCR扩增偏差。然而,PCR相关的测序错误对绝对RNA分子计数准确性的影响被低估了。研究表明,PCR错误导致大量和单细胞测序数据的不准确,对获得精确的RNA分子计数提出了重大挑战。研究人员提出了一种新的纠错解决方案,即利用同源三聚体核苷酸块合成UMIs。这种创新的方法有效地纠正了测序错误,使测序分子的绝对计数更准确。通过使用同源三聚体核苷酸块合成的UMIs,研究人员提高了RNA分子定量的准确性,克服了PCR误差带来的限制。
这项突破性的技术为我们在整体和单细胞水平上对基因表达和细胞过程的理解提供了很好的思路和一种更精确的RNA分子定量方法,此项创新为包括分子生物学、基因组学和生物医学研究在内的各个领域的研究开辟了新的途径。
随着研究人员不断完善和应用这种新方法,我们可以预测在分析基因表达模式、揭示疾病机制和开发靶向治疗方面的能力将进一步提高。
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