Nature子刊:开发出新型碱基编辑器
来源: | 作者: | 发布时间: 313天前 | 144 次浏览 | 分享到:


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近日,一项开创性的研究揭示了通过结构引导的方法,成功发现了几种高效且独立于序列上下文的胞嘧啶脱氨酶,这一突破性进展有望显著提升基因编辑技术的应用潜力,尤其是在基因治疗领域。

 

基因编辑中的胞嘧啶碱基编辑器由于对特定序列上下文的依赖性和脱靶效应的困扰,其应用受到限制。为了解决这些问题,研究团队采用了先进的人工智能工具AlphaFold2,预测了1,483种胞嘧啶脱氨酶的三维结构,并通过实验表征这些脱氨酶,找到了几种具有显著优势的新型脱氨酶。

 

通过AlphaFold2预测这些脱氨酶的三维结构,研究人员利用部分聚类方法将它们分类,并从每个结构簇中挑选出具有代表性的脱氨酶进行实验验证。此方法不仅高效,而且能够深入理解脱氨酶的结构功能关系。

 

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研究发现,几种新型脱氨酶在ACTCCCGC位点上诱导C-to-T转换时表现出相当的效率,展示了高编辑效率和多样的编辑窗口。这些脱氨酶可以在哺乳动物细胞中的单拷贝和多拷贝基因中引入终止密码子,而不会导致双链断裂,显著降低了潜在的基因编辑风险。

 

通过对一些预测的DNA相互作用位点的残基进行转换,研究团队成功减少了脱靶效应。这一发现为基因编辑技术的进一步优化提供了宝贵的参考。

 

研究团队指出,基于结构的生成性机器学习技术有望进一步扩展这些脱氨酶的应用范围。通过机器学习,科学家们可以设计出特异性更强、效率更高的碱基编辑器,从而推动基因治疗的发展。

 

这项研究不仅为碱基编辑技术提供了新的工具和方法,还为未来的基因编辑研究指明了方向。随着这些高效脱氨酶的应用,精准、高效且安全的基因编辑将变得更加现实。科学家们正向着治疗各种遗传性疾病的目标迈进,新的医学奇迹或将不再遥远。

 

这一突破性研究展示了科学技术在解决复杂生物学问题上的巨大潜力,也为全球科学界带来了新的希望。通过结构引导发现的高效胞嘧啶脱氨酶,基因编辑技术正迎来前所未有的发展机遇。


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