RNA分子的不同区域通常可以与不同的RNA结合蛋白(rbp)进行特定的相互作用，从而产生不同的RNA调节和功能模式。然而，目前还没有方法可以公正地鉴定活细胞和内源性环境下与特定RNA区域相互作用的rbp。研究人员揭示了一种称为TREX(靶向RNA-蛋白质交换)的开创性方法，该方法可以识别活细胞内与特定RNA区域结合的蛋白质。这项名为“TREX reveals proteins that bind to specific RNA regions in living cells”的研究代表了在理解RNA-蛋白质相互作用方面的重大进步，并有望在生物学和医学中的各种应用中得到应用。

图源：Nature Methods ：TREX reveals proteins that bind to specific RNA regions in living cells

RNA-蛋白相互作用在许多细胞过程中起着至关重要的作用，包括基因表达、RNA加工和调控。然而，在活细胞中研究这些相互作用提出了重大挑战。TREX方法通过识别活细胞复杂环境中与特定RNA区域相互作用的蛋白质，克服了这些障碍。

研究将TREX作为一种强大的工具，用于解开活细胞中RNA-蛋白质相互作用的复杂网络，通过提供一种识别与特定RNA区域结合的蛋白质的方法，TREX为理解基本生物过程和开发新的治疗策略开辟了新的途径。TREX方法结合了RNA标记、蛋白质交联、免疫沉淀和质谱分析等创新技术。这种综合方法使研究人员能够以前所未有的精度和灵敏度确定与靶RNA区域相关的蛋白质。

利用TREX，研究小组成功地识别了活细胞内与特定RNA区域结合的多种蛋白质，这些发现揭示了RNA-蛋白相互作用的复杂性及其在细胞功能中的作用，为后续的研究奠定了基础。

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